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R语言操作——TCGA数据处理

获取表达矩阵,处理TCGA的count数据,1表示为行。

r语言strc(R语言strsplit函数)
(图片来源网络,侵删)

软件:SAS、Grapdpri***、SPSS、R语言都可以用。但个人感觉SAS的算法更精准,Gradpri***在画图上更漂亮且易操作。看你需求了。

菲尔·斯佩克特的《R语言数据操作》展示了一系列将数据读入R并进行高效处理的方法。除了内置的函数,还包括了可以从CRAN(综合R档案网络)下载的大量现成的程序包。

r语言strc(R语言strsplit函数)
(图片来源网络,侵删)

R语言基础汇总

1、FUN = mean).t***ly函数根据第二个变量(Transect)的不同水平对第一变量(R)进行了求平均值运算。还可以求sd,var,length等操作。R语言初学者指南P75详细介绍了这个函数。

2、每一种分布有四个函数: d―density(密度函数),p―分布函数,q―分位数函数,r―随机数函数。 比如,正态分布的这四个函数为dnorm,pnorm,qnorm,rnorm。

r语言strc(R语言strsplit函数)
(图片来源网络,侵删)

3、向量是 R 语言中最基本的数据类型,在 R 中没有单独的标量(例如 1 本质上是 c(1)) 。R 中可以用 = 或者 - 来进行赋值 , -的快捷键是 alt + - 。

4、开始一个新的R语言数据分析新项目,管理脚本、图片、文件的推荐方式:打开Rstudio,新建Rproject,新建脚本(脚本存放在生成的Rproject文件夹中)。

R语言常用函数(基本)

R语言中,和排序相关的常用函数有: order() , sort() , rank() ,一般是对向量进行操作,也可以对数据框的列进行操作。

R语言中的数学函数除了三角函数之外,还有相应的指数函数和对数函数,常见的指数函数有exp,对数函数有log、log10。

就是R语言类率分布函数的开头字母。 比如说,正态分布是norm的化,那密度函数就是dnorm(),分布函数就是pnorm(), 更有用的是用相应分布生成随机数,比如rnorm(),就会生成服从正态分布的随机数。

read.table()函数是R最基本函数之一,主要用来读取矩形表格数据。各参数的说明如下:(1)file file是一个带分隔符的ASCII文本文件。 (2)header 一个表示文件是否在第一行包含了变量的逻辑型变量。

以上就是关于r语言strc和R语言strsplit函数的简单介绍,还有要补充的,大家一定要关注我们,欢迎有问题咨询体检知音。